Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trappc13Q3TIR1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms