Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms