Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccbe1Q3MI99 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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