Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cers3Q1A3B0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cers3Q1A3B0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cers3Q1A3B0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cers3Q1A3B0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cers3Q1A3B0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cers3Q1A3B0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms