Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptcd3Q14C51 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms