Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttc21bQ0HA38 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Ttc21bQ0HA38 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms