Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Cnn2Q08093 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnn2Q08093 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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