Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
MestQ07646 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MestQ07646 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MestQ07646 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms