Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col9a2Q07643 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms