Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms