Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Cntn3Q07409 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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