Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cab39Q06138 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms