Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Nf1Q04690 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms