Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GscQ02591 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GscQ02591 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GscQ02591 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms