Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zfp39Q02525 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms