Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ascl1Q02067 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms