Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EgfrQ01279 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms