Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pde1bQ01065 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pde1bQ01065 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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