Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms