Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms