Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms