Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Stx2Q00262 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms