Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cited1P97769 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms