Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms