Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx1P80205 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms