Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Vamp3P63024 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms