Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms