Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp46P62069 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms