Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms