Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Cldn18P56857 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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