Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TspoP50637 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TspoP50637 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms