Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
VdrP48281 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
VdrP48281 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VdrP48281 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VdrP48281 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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VdrP48281 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VdrP48281 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VdrP48281 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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