Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SrprbP47758 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrprbP47758 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SrprbP47758 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SrprbP47758 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SrprbP47758 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SrprbP47758 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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