Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pax9P47242 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms