Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
VhlP40338 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VhlP40338 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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