Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ThpoP40226 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms