Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpardP35396 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
PpardP35396 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpardP35396 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpardP35396 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PpardP35396 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms