Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptk2P34152 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms