Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nedd1P33215 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nedd1P33215 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms