Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gsx2P31316 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms