Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cd28P31041 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms