Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprmP28828 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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