Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RxrgP28705 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RxrgP28705 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RxrgP28705 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RxrgP28705 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RxrgP28705 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RxrgP28705 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RxrgP28705 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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