Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PdgfraP26618 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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