Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pou2f1P25425 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms