Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Hoxd12P23812 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Hoxd12P23812 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
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Hoxd12P23812 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd12P23812 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Hoxd12P23812 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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