Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd8P23463 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd8P23463 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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