Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkchP23298 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms