Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eif3aP23116 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms