Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms